Calon santri wajib membayar biaya masuk minimal Rp. 1.000.000,- sebagai persyaratan utama daftar ulang dan melakukan konfirmasi pembayaran dengan mengirimkan bukti pembayaran ke nomor Tata Usaha Pesantren Sintesa.
Bagi calon santri yang tidak membayar biaya masuk sesuai ketentuan, maka akan dianggap tidak melanjutkan pendidikan yang ada di Pesantren Sintesa.
Pelunasan biaya masuk dapat dibayarkan ketika:
Sebelum kedatangan santri baru.
Saat kedatangan santri baru.
Setelah kedatangan santri baru atau maksimal 1 (bulan) setelah kedatangan santri.